学术预告

学术预告:单分子实时(SMRT)测序技术即第三代测序技术及其在功能基因组研究中的应用

发布日期:2015-04-03 发表者:辛西 浏览次数:

时间:2015年4月9日(周四)下午14:30

地点:档案馆4楼会议室

报告人:黄文晋 博士

报告题目:单分子实时(SMRT)测序技术即第三代测序技术及其在功能基因组研究中的应用

摘要:单分子实时(SMRT)测序技术是继第二代测序(NGS)技术后唯一进入市场已达5年的第三代测序技术,通过平行对数以万计的单分子DNA分子的同时测序,SMRT测序技术解决了NGS的诸多局限,如:单分子DNA分子的平均读长可达10-15kb,准确率可以达到99.999%@30X;模板无需PCR扩增,避免了PCR偏好性,如PCR扩增加NGS短读长可能丢失10-15%的基因组信息(高GC或AT区域,高度重复序列,着丝粒区域等);模板无需PCR扩增同时保留了基因组的表观修饰信息,因此在测序同时可以给出表观修饰信息。由于SMRT测序独特优势,因此广泛应用于物种的De novo测序,重测序,或者结合NGS数据进一步完善基因组组装并且纠正既往基因组组装的错误等,还有就是解析结构变异(SV),等等。

黄文晋博士简介:基因有限公司市场部总经理,首席科学家,长期关注基因芯片、NGS和第三代测序等技术进展及应用

请学院老师准时参加。

信息学院

2015年4月3日