(文|黄紫阳)7月23日下午,信息学院2020年春季第8期“Happy Hour”交流会通过腾讯会议平台如期举行。
应学院大数据系章文教授邀请,中国矿业大学陈兴教授作了题为“大数据时代下基于网络算法和机器学习的非编码RNA相关预测研究”的学术报告。信息学院院长张红雨教授主持交流会。学院70余名师生参加会议,仔细聆听了报告并进行了热烈讨论。
陈兴教授是中国矿业大学生物信息研究所所长,中国矿业大学首批越崎学者,中国工业与应用数学学会数学生命科学专业委员会秘书长,2019年科睿唯安全球高被引科学家,2017年全球排名前十万科学家(排名全球第12060位)。陈兴教授首先指出大规模高通量的生物医学信息促使了生物信息学快速发展,并回顾了他领衔的团队近十年来在生物信息学领域取得的研究成果。接着他指出非编码RNA与人类疾病发生发展密切相关,对此的研究必将促进对疾病发病机制的认识,更重要的是有利于疾病的预防、诊断、治疗、预后。陈兴重点介绍了他们团队在miRNA-疾病关联预测方面的工作,归纳出4种预测框架:利用统计分析开发基于打分函数的模型、构建异质网络开发基于网络类似性的算法模型、基于样本特征信息开发机器学习的模型、利用疾病和基因、蛋白质等的关系开发不基于已知关系的预测模型,并对4种框架的优缺点做出归纳。随后谈即预测潜在miRNA-疾病关联的未来方向:引入更多生物数据信息,预测关联的存在与否及关联的类型,预测环境因素与miRNA和疾病之间的相互关联,利用深度学习提高预测精度。接着,陈兴介绍了其团队在lncRNA-疾病的关联预测问题上的一系列工作,指出计算模型预测潜在的lncRNA-疾病关联的框架。最后,陈兴教授指出非编码RNA可作为一类新的药物靶点,并介绍了他们团队2个关于药物的非编码RNA靶点预测的工作。
报告结束,陈兴和与会师生就相关问题进行了充分交流。本次“Happy Hour”活动圆满结束。
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