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美国西北大学王萍博士作题为“Dual Functions of Cohesin in Transcription Regulation”的报告

发布日期:2023-07-28 发表者:陈治国 浏览次数:




   (文|周强伟 编辑|辛西 审核|李国亮)7月27日下午,受我院李国亮教授邀请,美国西北大学王萍博士作客年度第8期Happy Hour活动,在一综B113会议室作了题为“Dual Functions of Cohesin in Transcription Regulation”的学术报告,向在场师生介绍了课题组在三维基因组领域染色质成环调控机制研究方面的最新进展。


   王萍博士首先介绍了她们课题组发现的染色质交互成环机制,主要是通过ChIA-Drop技术发现染色质成环过程的数种统计结果:包括双端同时滑动的成环过程(在热图交互中呈现垂直对角线),以及单端滑动成环过程(在热图交互中呈现45°对角线)等。此外,进一步基于可在单分子水平上观察染色质交互的ChIA-Drop技术,她们发现,大多数染色质交互都处于成环过程中,而稳定的loop(交互两端存在CTCF锚点)仅占总loop一小部分比例,该结论提出一项染色质结构形成的新认知。最后,王萍博士分享了在RAD21蛋白降解后的惊喜发现,通过RAD21蛋白降解实验,王萍博士发现远距离(约200kb)染色质交互主要依赖于cohesin,而短距离交互(约25kb)则不依赖cohesin,这一发现对目前染色质成环和调控转录研究具有非常重要的意义。


   报告最后,王萍博士介绍了其团队在白血病ALL中的三维研究工作,研究发现FLT3基因在ZNF384重排的ALL中被独特激活,该交互是由融合蛋白直接介导增强子-启动子交互产生的结果。


   报告结束,学院李国亮教授、李立教授及生命医学健康学院李礼教授等与王萍博士进行了热烈讨论,内容涉及ChIA-Drop实验目前的稳定性、CTCF方向与TSS转录方向不同却能成环的可能性等问题。


   活动负责人表示,本次学术报告取得圆满成功,王萍博士研究成果为染色质成环领域带来了新突破,也为基因调控研究提供了有益启示。