为了进一步激发大学生学习生物信息知识的兴趣,提高专业技能,强化创新意识、实践技能及团队精神,营造自主学习、多元发展的良好氛围,充分展示生物信息“项目育人”特色学科建设成果,经研究,现面向全校本科生举办“华中农业大学第九届生物信息设计与技能竞赛”。相关事宜通知如下:
一、组织机构
主办单位:华中农业大学本科生院
承办单位:华中农业大学信息学院
二、参赛方式
(一)参赛对象:校内生物科学、信息科学相关专业全日制本科生,全体2020级生物信息系本科生。
(二)队伍组成:(1)自由组队方式:1-4人自愿灵活组成参赛队伍,每支队伍自由推选1名队长和选择1名指导老师。(2)“项目育人”实训组队方式:以生物信息专业项目实训小组作为参赛队伍,默认原项目组长及指导老师为各队队长和指导老师。要求:每人次仅限参加1支队伍;每位教师参与指导的队伍不得多于3支。
三、竞赛内容
赛 道 |
竞赛内容 |
作品要求 |
第一赛道: 生物信息算法与软件的设计和优化 |
1.生物信息学算法设计、改进或软件优化 如提高常用生物信息学软件的运行效率,高性能并行算法和程序的设计与开发等。 2.生物信息学软件的集成和多平台化 如针对某个实验或分析流程,建立常用软件的流水线,开发在线或移动端的分析工具等。 3.生物信息数据库或网络服务开发 如二次生物信息(非第一手实验数据)的数据库开发,生物信息数据的在线搜索与查询的网络服务的开发等。 4.数字和多媒体资源制作 如制作介绍生物信息学相关研究内容的网页、网站、动画演示,制作生物信息学相关内容的多媒体小课件等。 |
1.论证算法或软件的设计思路及创新性,证明算法或软件切实可用或效率更高。 2.提交设计流程图以及本地、在线或移动端中至少一个平台的软件及源代码。 3.提交数据库或网络服务的完整程序和数据,并进行相应数据查询与展示方式的操作演示。 4.提交所制作的数字和多媒体资源,并进行现场介绍和演示。 |
第二赛道: 数据挖掘、统计分析、机器学习与预测 |
1.基因组、转录组、蛋白组、代谢组 2.药物组、定量构效关系、化学信息学 3.表型组、数量遗传学 4.其他组学数据 |
1.模式特征提取与预测。 2.聚类分析、相关性分析、进化分析等。 3.参考学术论文的格式,提交分析报告。 4.制作PPT,现场答辩。 |
第三赛道: 生物系统的建模与模拟 |
1.生物网络分析 如生物网络的构建,拓扑特征分析,网络模体(Motif)识别,模块性分析,层次性分析,网络整合与进化分析等。 2.生物过程的建模与模拟 如生理生化过程的建模与模拟,细胞行为的建模与模拟,生物分子及其相互作用的建模与模拟等。 3.基因回路设计 如构建各种检测回路、开关回路、振荡回路、逻辑门回路及其组合回路、记忆和时序回路、模拟计算回路、生物计算机等,鼓励面向实际问题(如环境能源,医疗健康等)的回路设计与应用。 |
1.以常用的数据格式,提交完整的网络模型,并参考学术论文的格式,提交分析报告,制作PPT,现场答辩。 2.提交完整的模型描述,包括问题背景、模型数据、软件代码等,展示模拟过程和结果,制作PPT,现场答辩。 3.提交完整的设计路线图及相关描述文档,论证基因回路的可行性及其应用价值或潜力,制作PPT,现场答辩。 |
四、奖项设置
参赛队伍提交相关材料,进行现场展示后,大赛评委会根据各参赛队的实际工作量及设计的完整性、可行性及创新性综合评价及打分,拟评选如下奖项予以奖励:
奖项等次 |
奖励金额 (元/队) |
第一赛道 |
第二赛道 |
第三赛道 |
奖励合计 (元) |
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胜出奖 |
一等奖 |
1500.00 |
1 |
1 |
1 |
4500.00 |
二等奖 |
1200.00 |
1 |
1 |
1 |
3600.00 |
|
三等奖 |
900.00 |
1 |
1 |
1 |
2700.00 |
|
合 计 |
3 |
3 |
3 |
10800.00 |
五、时间安排
1.参赛报名:请各队学生充分考虑参与项目及竞赛赛道内容后,下载并填写《华中农业大学第九届生物信息设计与技能竞赛报名表》,并于2023年9月10日17:00前发送至信息学院科创中心公共邮箱:3444973850@qq.com,《报名表》以“Bic-HZAU+队名+队长姓名”命名。
2.作品提交及评选:参赛队伍按照大赛要求完成作品,并于2023年9月24日17:00前将相关资料打包发送至科创中心公共邮箱:3444973850@qq.com。邮件标题以“BiC-HZAU+队名+队长姓名”命名。展示评选日期暂定为2023年9月27日,届时需进行现场答辩、作品展示及颁奖仪式等。具体提交时间、评选要求、答辩场地及其他未尽事宜等将在QQ群(群号:809415576)另行通知。
华中农业大学信息学院
2023年7月4日
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