全源

姓名

全源

性别


职称

副研究员

学位

博士

电话

18062425336

邮箱

quanyuan@mail.hzau.edu.cn

政治面貌

中共党员

工作单位

华中农业大学信息学院

研究方向

系统生物医学、生物信息学、药物信息学

教育经历

2009.09-2013.07 华中农业大学、生物科学基地班、理学学士学位

2013.08-2018.06 华中农业大学、生物信息学专业、理学博士学位

主要职历

2018.07-2020.10 哈尔滨工业大学、计算机科学与技术博士后流动站,博士后

科研成果

研究内容包括:基于多种系统生物医学、生物信息学及药物信息学策略,通过整合和挖掘多组学数据,完成对多种疾病(包括癌症、精神系统疾病、慢性疾病)的致病机制解析。此外,还将进化生物学概念引入药物靶标发现,提升药物发现效率。

代表性论文

1. Quan Y#, Wang ZY#, Chu XY, Zhang HY*. Evolutionary and genetic features of drug targets. Med. Res. Rev. 2018, 38(5): 1536-1549. (JCR 1区,2019 IF = 9.300)

2. Quan Y, Zhang HY*. A chemical-genetic criterion for identifying disease biomarkers. Trends Mol. Med. 2016, 22(6): 447-448. (JCR 1区,2019 IF = 11.099)

3. Tong XY#, Quan Y#, Zhang HY*. NUDT5 as a novel drug target and prognostic biomarker for ER-positive breast cancer. Drug Discov. Today 2020, 26(3): 620-625. (JCR 1区,2019 IF = 7.321)

4. Quan Y#, Liang F#, Zhu Y, Chen Y, Xu Z, Du F, Lv K, Chen H, Qu L, Xu R, Zhang HY, Xiong J*, Li Y*. Integrated analysis of DNA methylation and biochemical/metabolic parameter during the long-term isolation environment. Front. Physiol. 2019, 10: 917. (JCR 1区,2019 IF = 3.367)

5.Quan Y#*, Liang F#, Wu D#, Yao X#, Hu Z , Zhu Y, Chen Y, Wu A , Tang D, Huang B, Xu R, Lyu Z, Yan Q, Luo L, Ning Z*, Li Y*, Xiong J*. Blood cell DNA methylation of aging-related ubiquitination gene DZIP3 can predict the onset of early stage colorectal cancer. Front. Oncol. 2020, 10:544330. (JCR 2区,2019 IF = 4.848)

其他一作/通讯论文

1. Liang F#, Quan Y#, Wu A, Chen Y, Xu R, Zhu Y, Xiong J*. Insulin-resistance and depression cohort data mining to identify nutraceutical related DNA methylation biomarker for type 2 diabetes. Genes Dis. 2020, doi: 10.1016/j.gendis.2020.01.013. (JCR 1区,2019 IF = 4.803)

2.Quan Y, Li B, Sun YM, Zhang H-Y*. Elucidating pharmacological mechanisms of natural medicines by biclustering analysis of the gene expression profile: a case study on curcumin and Si-Wu-Tang. Int. J. Mol. Sci. 2014, 16(1): 510-520. (JCR 1区,2019 IF = 4.556)

3.Quan Y, Zhang HY, Xiong JH, Xu RF, Gao M*. Heat diffusion kernel algorithm-based interpretation of the disease intervention mechanism for DHA. Genes (Basel) 2020, 11(7): 754. (JCR 2区,2019 IF = 3.759)

4.Quan Y#, Luo ZH#, Yang QY#, Li J, Zhu Q, Liu YM, Lv BM, Cui ZJ, Qin X, Xu YH, Zhu LD*, Zhang HY*. Systems chemical genetics-based drug discovery: prioritizing agents targeting multiple/reliable disease-associated genes as drug candidates. Front. Genet. 2019, 10: 474. (JCR 2区,2019 IF = 3.258)

5. Gao M, Quan Y*, Zhou XH, Zhang HY*. PheWAS-based systems genetics methods for anti-breast cancer drug discovery. Genes (Basel) 2019, 10(2): 154. (JCR 2区,2019 IF = 3.759)

6.Quan Y#, Xiong L#, Chen J, Zhang HY*. Genetics-directed drug discovery for combating Mycobacterium tuberculosis infection. J. Biomol. Struct. Dyn. 2017, 35(3): 616-621. (JCR 2区,2019 IF = 3.31)

7.Quan Y#, Liu MY#, Liu YM, Zhu LD, Wu YS, Luo ZH, Zhang XZ, Xu SZ, Yang QY, Zhang HY*. Facilitating anti-cancer combinatorial drug discovery by targeting epistatic disease genes. Molecules 2018, 23(4): 736. (JCR 2区,2019 IF = 3.267)

8.Quan Y*, Zhang QY, Lv BM, Xu RF, Zhang HY*. Genome-wide pathogenesis interpretation using a heat diffusion-based systems genetics method and implications for gene function annotation. Mol. Genet. Genomic Med. 2020, 8(10): e1456. (JCR 3区,2019 IF = 1.995)

9. Zhang XZ#, Quan Y#, Tang GY*. Medical genetics-based drug repurposing for Alzheimer's disease. Brain Res. Bull. 2015, 110: 26-29. (JCR 2区,2019 IF = 3.370)

10.Quan Y, Wang ZY, Xiong M, Xiao ZT, Zhang HY*. Dissecting traditional Chinese medicines by omics and bioinformatics. Nat. Prod. Commun. 2014, 9(9): 1391-6. (JCR 4区,2019 IF = 0.468)

11.Quan Y, Zhang HY*. Chemical genetic validation of GWAS-derived disease loci. Curr. Bioinform. (accepted,JCR 3区,2019 IF = 2.068)

12.Quan Y#*, Liang F#, Deng SM, Zhu Y, Chen Y, Xiong J*. Mining the Selective Remodeling of DNA Methylation in Promoter Regions to Identify Robust Gene-Level Associations with Phenotype. Front. Mol. Biosci. (revised,JCR 2区,2019 IF = 4.188)

获得专利

1. 张红雨, 全源, 王晖, 朱丽达, 许璇, 杨庆勇, 黄清. 一种基于热扩散网络的药物发现方法及其应用, 2019年9月, 中国, 专利号:ZL201710917312.2.

2. 张红雨, 全源, 王晖, 朱丽达, 许璇, 杨庆勇, 黄清. 一种药物活性的预测方法及其应用, 2020年1月, 中国, 专利号:ZL201710769899.7.

3. 张红雨, 杨庆勇, 全源, 罗志辉, 朱丽达. 多靶标药物和/或组合药物的筛选方法, 2017年9月, 中国, 专利号:ZL201510288863.8;2020年8月, 欧洲, 专利号:3306503.

4. 张红雨, 吕博敏, 全源, 张青叶, 黄清. 卡马西平在制备治疗黄病毒属病毒感染的药物中的应用, 2019年11月, 中国, 专利号:ZL201810039105.6.

5. 张红雨, 吕博敏, 全源, 张青叶, 黄清. 一种含有卡马西平和生物素的药物组合物及其应用, 2019年11月, 中国, 专利号:ZL201810039104.1.

6. 张红雨, 吕博敏, 全源, 张青叶, 黄清. 一种药物组合物及其在制备治疗黄病毒属病毒感染的药物中的应用, 2020年6月, 中国, 专利号:Z201711442237.5.

7. 张红雨, 杨庆勇, 张红雨, 朱丽达, 罗志辉, 全源, 朱强, 杨庆勇. 一种基于机器学习的药物活性预测方法, 2017年4月, 中国, 专利号:ZL201610067573.5.

备注