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关于举办华中农业大学第九届生物信息设计与技能竞赛的通知

发布日期:2023-07-04 发表者:王立金 浏览次数:

为了进一步激发大学生学习生物信息知识的兴趣,提高专业技能强化创新意识、实践技能及团队精神,营造自主学习、多元发展的良好氛围,充分展示生物信息“项目育人”特色学科建设成果,经研究,面向全校本科生举办华中农业大学第届生物信息设计与技能竞赛事宜通知如下:

一、组织机构

主办单位:华中农业大学本科生院

承办单位:华中农业大学信息学院

二、参赛方式

(一)参赛对象:校内生物科学、信息科学相关专业全日制本科生,全体2020生物信息系本科生

(二)队伍组成:1)自由组队方式:1-4人自愿灵活组成参赛队伍,每支队伍自由推选1名队长和选择1名指导老师。(2)“项目育人”实训组队方式:以生物信息专业项目实训小组作为参赛队伍,默认原项目组长及指导老师为各队队长和指导老师。要求:每人次仅限参加1支队伍;每位教师参与指导的队伍不得多于3支。

三、竞赛内容

竞赛内容

作品要求

第一赛道:

生物信息算法与软件的设计和优化

1.生物信息学算法设计、改进或软件优化

如提高常用生物信息学软件的运行效率,高性能并行算法和程序的设计与开发等。

2.生物信息学软件的集成和多平台化

如针对某个实验或分析流程,建立常用软件的流水线,开发在线或移动端的分析工具等。

3.生物信息数据库或网络服务开发

如二次生物信息(非第一手实验数据)的数据库开发,生物信息数据的在线搜索与查询的网络服务的开发等。

4.数字和多媒体资源制作

如制作介绍生物信息学相关研究内容的网页、网站、动画演示,制作生物信息学相关内容的多媒体小课件等。

1.论证算法或软件的设计思路及创新性,证明算法或软件切实可用或效率更高。

2.提交设计流程图以及本地、在线或移动端中至少一个平台的软件及源代码。

3.提交数据库或网络服务的完整程序和数据,并进行相应数据查询与展示方式的操作演示。

4.提交所制作的数字和多媒体资源,并进行现场介绍和演示。

第二赛道:

数据挖掘、统计分析、机器学习与预测

1.基因组、转录组、蛋白组、代谢组

2.药物组、定量构效关系、化学信息学

3.表型组、数量遗传学

4.其他组学数据

1.模式特征提取与预测。

2.聚类分析、相关性分析、进化分析等。

3.参考学术论文的格式,提交分析报告。

4.制作PPT,现场答辩。

第三赛道:

生物系统的建模与模拟

1.生物网络分析

如生物网络的构建,拓扑特征分析,网络模体(Motif)识别,模块性分析,层次性分析,网络整合与进化分析等。

2.生物过程的建模与模拟

如生理生化过程的建模与模拟,细胞行为的建模与模拟,生物分子及其相互作用的建模与模拟等。

3.基因回路设计

如构建各种检测回路、开关回路、振荡回路、逻辑门回路及其组合回路、记忆和时序回路、模拟计算回路、生物计算机等,鼓励面向实际问题(如环境能源,医疗健康等)的回路设计与应用。

1.以常用的数据格式,提交完整的网络模型,并参考学术论文的格式,提交分析报告,制作PPT,现场答辩。

2.提交完整的模型描述,包括问题背景、模型数据、软件代码等,展示模拟过程和结果,制作PPT,现场答辩。

3.提交完整的设计路线图及相关描述文档,论证基因回路的可行性及其应用价值或潜力,制作PPT,现场答辩。

 四、奖项设置

参赛队伍提交相关材料,进行现场展示后,大赛评委会根据各参赛队的实际工作量及设计的完整性、可行性及创新性综合评价及打分拟评选如下奖项予以奖励:

奖项等次

奖励金额

(元/队)

第一赛道

第二赛道

第三赛道

奖励合计

(元)

胜出奖

一等奖

1500.00

1

1

1

4500.00

二等奖

1200.00

1

1

1

3600.00

三等奖

900.00

1

1

1

2700.00

3

3

3

10800.00

五、时间安排

1.参赛报名:请各队学生充分考虑参与项目及竞赛赛道内容后,下载填写《华中农业大学第届生物信息设计与技能竞赛报名表》,并202391017:00发送至信息学院科创中心公共邮箱:3444973850@qq.com,《报名表》以Bic-HZAU+队名+队长姓名”命名

2.作品提交及评选:参赛队伍按照大赛要求完成作品,202392417:00前将相关资料打包发送至科创中心公共邮箱3444973850@qq.com。邮件标题以BiC-HZAU+队名+队长姓名命名。展示评选日期暂定为2023927,届时需进行现场答辩、作品展示及颁奖仪式等。具体提交时间、评选要求、答辩场地及其他未尽事宜等将在QQ群(群号:809415576)另行通知。

                                                             华中农业大学信息学院

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 华中农业大学第九届生物信息设计与技能竞赛报名表.doc