为了进一步激发大学生学习生物信息知识与技能的兴趣,强化大学生的创新意识、实践技能及团队精神,活跃自主学习、多元发展的良好氛围,经研究决定,面向全校本科生,利用寒假前后课余时间,举办“华中农业大学第三届生物信息设计与技能竞赛”。有关事项通知如下:
一、参赛方式
(一)参赛对象:校内生物信息、生物科学及相关专业全日制本科生,重点面向2013-2014级。不对研究生和外校本科生开放。
(二)队伍组成:每1-3名大学生灵活组队,1名同学仅限参加一支队伍;每支队伍自由选择1-2名指导教师,每位教师参与指导的队伍不得多于3支。
二、竞赛内容
赛 道 | 竞赛内容 | 作品要求 |
第一赛道: 生物信息算法与软件的设计和优化 | 1.生物信息学算法设计、改进或软件优化 如提高常用生物信息学软件的运行效率,高性能并行算法和程序的设计与开发等。 2.生物信息学软件的集成和多平台化 如针对某个实验或分析流程,建立常用软件的流水线,开发在线或移动端的分析工具等。 3.生物信息数据库或网络服务开发 如二次生物信息(非第一手实验数据)的数据库开发,生物信息数据的在线搜索与查询的网络服务的开发等。 4.数字和多媒体资源制作 如制作介绍生物信息学相关研究内容的网页、网站、动画演示,制作生物信息学相关内容的多媒体小课件等。 | 1.论证算法或软件的设计思路及创新性,证明算法或软件切实可用或效率更高。 2.提交设计流程图以及本地、在线或移动端中至少一个平台的软件及源代码。 3.提交数据库或网络服务的完整程序和数据,并进行相应数据查询与展示方式的操作演示。 4.提交所制作的数字和多媒体资源,并进行现场介绍和演示。 |
第二赛道: 组学数据的挖掘与统计分析 | 1.基因组 2.转录组 3.蛋白组 4.其他组学数据 | 1.模式特征提取与预测。 2.聚类分析、相关性分析、进化分析等。 3.参考学术论文的格式,提交分析报告。 4.制作PPT,现场答辩。 |
第三赛道: 生物系统的建模与模拟 | 1.生物网络分析 如生物网络的构建,拓扑特征分析,网络模体(Motif)识别,模块性分析,层次性分析,网络整合与进化分析等。 2.生物过程的建模与模拟 如生理生化过程的建模与模拟,细胞行为的建模与模拟,生物分子及其相互作用的建模与模拟等。 3.基因回路设计 如构建各种检测回路、开关回路、振荡回路、逻辑门回路及其组合回路、记忆和时序回路、模拟计算回路、生物计算机等,鼓励面向实际问题(如环境能源,医疗健康等)的回路设计与应用。 | 1.以常用的数据格式,提交完整的网络模型,并参考学术论文的格式,提交分析报告,制作PPT,现场答辩。 2.提交完整的模型描述,包括问题背景、模型数据、软件代码等,展示模拟过程和结果,制作PPT,现场答辩。 3.提交完整的设计路线图及相关描述文档,论证基因回路的可行性及其应用价值或潜力,制作PPT,现场答辩。 |