通知公告

关于举办华中农业大学第三届生物信息设计与技能竞赛的通知

发布日期:2016-12-30 发表者:辛西 浏览次数:

为了进一步激发大学生学习生物信息知识与技能的兴趣,强化大学生的创新意识、实践技能及团队精神,活跃自主学习、多元发展的良好氛围,经研究决定,面向全校本科生,利用寒假前后课余时间,举办“华中农业大学第三届生物信息设计与技能竞赛”。有关事项通知如下:

一、参赛方式

(一)参赛对象:校内生物信息、生物科学及相关专业全日制本科生,重点面向2013-2014级。不对研究生和外校本科生开放。

(二)队伍组成:每1-3名大学生灵活组队,1名同学仅限参加一支队伍;每支队伍自由选择1-2名指导教师,每位教师参与指导的队伍不得多于3支。

二、竞赛内容

赛 道

竞赛内容

作品要求

第一赛道:

生物信息算法与软件的设计和优化

1.生物信息学算法设计、改进或软件优化

如提高常用生物信息学软件的运行效率,高性能并行算法和程序的设计与开发等。

2.生物信息学软件的集成和多平台化

如针对某个实验或分析流程,建立常用软件的流水线,开发在线或移动端的分析工具等。

3.生物信息数据库或网络服务开发

如二次生物信息(非第一手实验数据)的数据库开发,生物信息数据的在线搜索与查询的网络服务的开发等。

4.数字和多媒体资源制作

如制作介绍生物信息学相关研究内容的网页、网站、动画演示,制作生物信息学相关内容的多媒体小课件等。

1.论证算法或软件的设计思路及创新性,证明算法或软件切实可用或效率更高。

2.提交设计流程图以及本地、在线或移动端中至少一个平台的软件及源代码。

3.提交数据库或网络服务的完整程序和数据,并进行相应数据查询与展示方式的操作演示。

4.提交所制作的数字和多媒体资源,并进行现场介绍和演示。

第二赛道:

组学数据的挖掘与统计分析

1.基因组

2.转录组

3.蛋白组

4.其他组学数据

1.模式特征提取与预测。

2.聚类分析、相关性分析、进化分析等。

3.参考学术论文的格式,提交分析报告。

4.制作PPT,现场答辩。

第三赛道:

生物系统的建模与模拟

1.生物网络分析

如生物网络的构建,拓扑特征分析,网络模体(Motif)识别,模块性分析,层次性分析,网络整合与进化分析等。

2.生物过程的建模与模拟

如生理生化过程的建模与模拟,细胞行为的建模与模拟,生物分子及其相互作用的建模与模拟等。

3.基因回路设计

如构建各种检测回路、开关回路、振荡回路、逻辑门回路及其组合回路、记忆和时序回路、模拟计算回路、生物计算机等,鼓励面向实际问题(如环境能源,医疗健康等)的回路设计与应用。

1.以常用的数据格式,提交完整的网络模型,并参考学术论文的格式,提交分析报告,制作PPT,现场答辩。

2.提交完整的模型描述,包括问题背景、模型数据、软件代码等,展示模拟过程和结果,制作PPT,现场答辩。

3.提交完整的设计路线图及相关描述文档,论证基因回路的可行性及其应用价值或潜力,制作PPT,现场答辩。